Pod względem geograficznym obszar gminy Nidzica leży na styku trzech podprowincji geograficznych: Pojezierzy Wschodnio- Bałtyckich, Pojezierzy południowo- Bałtyckich i Niziny Środkowo- Polskiej.
Większą część gminy na północ od miasta zajmują zwarte kompleksy leśne. Krajobraz urozmaica bogata rzeźba terenu, liczne jeziora, doliny rzeczne.
Na obszarze gminy Nidzica występuje jeden z głównych zbiorników wód podziemnych w Polsce. Przebiega przez nią dział wodny pierwszego rzędu oddzielajacy dorzecze Wisly od dorzecza Pregoły. Dział ten oddziela położony w północnej części gminy niewielki obszar odwadniany przez rzekę Łynę będącą prawostronnym dopływem Pregoły od pozostałych terenów włączonych poprzez system rzek Omulew i Nida do dorzecza Wisły.
(Fot. Pixabay / CC0)